A Shindo Yoshin-ryu foi fundada por um representante do clã Tokugawa, Katsunosuke Matsuoka em 1868. Matsuoka Sensei estudou Yoshin-ryu, Hokushin Itto-ryu, Jikishinkage-ryu, Tenjin Shinyo-ryu jujutsu e Hozoin-ryu. Baseou a Shindo Yoshin-ryu na Yoshin-ryu, mas também adicionou conceitos das outras escolas. Ele acreditava que os conceitos de defesa passiva da Yoshin-ryu eram incompletos e necessitavam de equilíbrio e heiho positivo ou tácticas. Os caracteres Japoneses originais de Shindo Yoshin-ryu eram "novo espírito do salgueiro," mas em breve foram mudados para "espírito sagrado do salgueiro"
O curriculum original da Shindo Yoshin-ryu poderia mais correctamente ser considerado um bujutsu que um jujutsu pois muitas técnicas de armas estão incluídas no curriculum (mokuroku). Contudo, a popularidade do judo e o pouco interesse no treino de armas resultou em que muita dessa influencia fosse perdida no inicio do século XX nas principais linhas de tradições Marciais.
Muitas das raízes da nossa escola começam nos anos iniciais. Meu avô Shigeta Ohbata era originalmente um estudante de Yoshin-ryu com Hikosuke Totsuka tal como Matsuoka. Totsuka era evidentemente fantástico. Meu avô treinou no seu Dojo antes de conhecer Matsuoka Sensei. No seu tempo, Totsuka era considerado um adversário à altura de qualquer um. Absolutamente um técnico brilhante. No seu pico, dizia-se que era imbatível fosse por quem fosse inclusive por adversários muito maiores que ele.
Apesar do grande respeito do meu avô por Totsuka, ele saiu da Yoshin-ryu encontrando depois um estudante de Matsuoka chamado Ishijima. Shigeta eventualmente acabou por receber um menkyo kaiden (licença de ensino) em Shindo Yoshin-ryu por volta de 1895. Matsuoka e Shigeta ambos treinaram Jikishinkage-ryu com Kenkichi Sakakibara por isso desenvolveram uma amizade próxima. Meu Avô não tinha intenção de começar a sua própria escola mas fê-lo efectivamente no inicio do século 20. Esta ficou conhecida como a escola Ohbata. Ele construiu o seu próprio Dojo com a ajuda de um amigo de seu nome Hasegawa em Asakusa no distrito de Tokyo.
A Shindo Yoshin-ryu é bastante conhecida no mundo do Karate Japonês porque o Hironori Ohtsuka fundador da Wado-Ryu Jujutsu Kenpo (karate) recebeu um menkyo kaiden em Shindo Yoshin Ryu. No entanto existe uma concepção errada comum entre a maioria dos praticantes de Wado-Ryu, a de que Hironori Ohtsuka tornou-se o grande mestre da Shindo Yoshin Ryu. Embora tenha realmente recebido um menkyo kaiden em Shindo Yoshin Ryu, também vários outros o receberam resultando em diversas escolas. A linha original (linha Matsuoka) sucedeu através de Motoyoshi Saruse para Tatsuo Matsuoka e ainda existe hoje no Japão.